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孕激素通常在雌激素的作用基础上发挥作用。

1.生殖系统：使子宫增殖期内膜转化为分泌期内膜，为受精卵着床作准备。使宫口闭合，粘液分泌减少，性状变粘稠，拉丝度变短，不利于精子穿透。抑制输卵管节律性收缩的振幅，抑制上皮纤毛生长，调节孕卵运行。加快阴道上皮脱落。在卵泡内抑制颗粒细胞的增殖。孕激素在月经中期具有增强雌激素对垂体LH排卵峰释放的正反馈作用；在黄体期对下丘脑、垂体有负反馈作用，抑制促性腺激素分泌。降低平滑肌兴奋性，抑制子宫肌层收缩，降低对缩宫素的敏感性，有利于胚胎宫内生长发育。

2.乳腺：在雌激素作用的基础上，孕激素与催乳激素一起促使腺泡发育。

3.代谢：促进水钠排泄。

4.体温：孕酮对体温调节中枢具有兴奋作用，可使基础体温（BBT）在排卵后升高0.3～0.5℃。临床上可以此作为排卵日期的标志之一。